蛋白质作为生命活动的直接参与者，其种类、丰度和翻译后修饰状态直接决定细胞的功能表现。与DNA测序侧重于“潜在编码信息”不同，蛋白质测序致力于揭示“实际表达与功能状态”。通过精确测定蛋白质序列与修饰信息，研究人员能够全面理解细胞行为、疾病机制和药物响应过程。在蛋白质测序中，质谱（Mass Spectrometry, MS）技术扮演着核心角色，特别是液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）方法，已成为当前主流的蛋白测序平台。

一、蛋白质测序的基本原理

蛋白质测序的核心是通过质谱测定多肽片段的质量和碎裂模式，从而推断其氨基酸序列。测序流程通常包括以下关键原理：

1、酶切生成多肽

使用胰蛋白酶等蛋白酶将目标蛋白切割为稳定、可解析的多肽段。

2、色谱分离

将复杂的多肽混合物通过高效液相色谱（LC）分离，提高检测分辨率。

3、质谱分析

进入质谱仪后，首先通过一级MS（MS1）测定肽段的质量，然后选定特定肽段进行二级碎裂（MS2）分析其氨基酸序列特征。

4、数据库比对

将获得的碎裂谱图与蛋白数据库进行匹配，从而鉴定肽段与对应蛋白。

通过对全样本的肽段频率、强度、修饰等数据统计，可进一步实现蛋白质的定性鉴定与定量分析。

二、蛋白测序的主要步骤

步骤1：蛋白提取与定量

从细胞、组织或体液中提取总蛋白，利用BCA、Bradford等方法进行浓度测定，为后续处理提供标准化起点。

步骤2：蛋白还原、烷基化与酶解

通过DTT还原二硫键，IAA烷基化游离巯基，使蛋白质构象展开，随后使用胰蛋白酶等进行高效酶解，生成可用于MS分析的多肽。

步骤3：多肽纯化与分级

通过固相萃取（如C18柱）或高pH反相分级减少复杂度，提升质谱上机效率和数据覆盖率。

步骤4：LC-MS/MS检测

多肽经液相系统分离后进入质谱仪进行MS1和MS2检测，获得完整的质谱数据集。

步骤5：数据分析与蛋白鉴定

利用MaxQuant、Proteome Discoverer等分析平台进行数据库检索、肽段定性与蛋白定量、差异分析、GO/KEGG注释等信息学挖掘。

三、蛋白质测序策略选择：定量与修饰并重

根据研究目的不同，蛋白质测序可选择不同的策略：

1、Label-Free：无需标记，操作简便，适用于大样本或早期筛选研究

2、TMT/iTRAQ：同位素标签法，适合多组间定量比较，灵敏度高

3、SILAC：稳定同位素代谢标记，适用于细胞体系内源性标记

4、PTM分析：专注于磷酸化、乙酰化等翻译后修饰位点的检测与定量

百泰派克生物科技可根据项目需求，制定最适配的蛋白组策略，实现覆盖率、定量精度和生物学深度的最佳平衡。

四、百泰派克生物科技蛋白质测序服务优势

作为国内领先的蛋白组服务平台，百泰派克生物科技在蛋白质测序方面构建了系统化技术流程和行业领先的质谱平台：

• 多种样本类型支持：细胞、组织、血清、外泌体等
• 高灵敏质谱平台：Orbitrap Exploris、Fusion Lumos、timsTOF等
• 专业前处理流程：自动化酶解、纯化与富集系统
• 深度数据挖掘：定量分析、通路富集、蛋白互作网络
• 多组学融合：可与转录组、代谢组、化学蛋白组学联动解析

蛋白测序作为揭示功能蛋白状态的核心手段，正在从基础研究迈向疾病诊断、靶点筛选、药物机制研究等多领域拓展。借助先进的质谱平台与定制化流程，百泰派克生物科技为科研人员提供高质量、高通量、可解释的蛋白组数据支持。欢迎联系百泰派克，获取定制化蛋白质测序方案，让您的研究更进一步！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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